熱力滅菌時可靠而普遍應用的滅菌法，包括濕熱滅菌和干熱滅菌法。在天士力凍干粉針車間，干熱滅菌器用于干燥水桶等不銹鋼器具。濕熱滅菌器用于干燥泵，衣服等物品。
1．濕熱滅菌法在同樣的溫度下，溫熱的殺菌效果比干熱好，其原因有：①蛋白質凝固所需的溫度與其含水量有關，含水量愈大，發生凝固所需的溫度愈低。濕熱滅菌的菌體蛋白質吸收水分，較同一溫度的干熱空氣中易于凝固。②溫熱滅菌過程中蒸氣放出大量潛熱，加速提高濕度。因而濕熱滅菌比干熱所要溫度低，如在同一溫度下，則濕熱滅菌所需時間比干熱短。③濕熱的穿透力比干熱大，使深部也能達到滅菌溫度，故濕熱比干熱收效好。
濕熱滅菌法包括有：
（1）煮沸法：煮沸100℃，5分鐘，能殺死一般細菌的繁殖體。許多芽胞需經煮潮5～6小時才死亡。水中加入2%碳酸鈉，可提高其沸點達105℃。既可促進芽胞的殺滅，又能防止金屬器皿生銹。煮沸法可用于飲水和一般器械（刀剪、注射器等）的消毒。
（2）流通蒸汽滅菌法：利用100℃左右的水蒸汽進行消毒，一般采用流通蒸汽滅菌器（其原理相當于我國的蒸籠），加熱15到39分鐘，可殺死細菌繁殖體。消毒物品的包裝不宜過大、過緊以利于蒸汽穿透。
（3）間歇滅菌法：利用反復多次的流通蒸汽，以達到滅菌的目的。一般用流通蒸汽滅菌器，100℃加熱15～30分鐘，可殺死其中的繁殖體；但芽胞尚有殘存。取出后放37℃孵箱過夜，使芽胞發育成繁殖體，次日再蒸一次，如此連續三次以上。本法適用于不耐高溫的營養物（如血清培養基）的滅菌。
（4）巴氏消毒法（Pasteurization）：利用熱力殺死液體中的病原菌或一般的雜菌，同時不致嚴重損害其質量的消耗方法。由巴斯德創用以消毒酒精類，故名。加溫61.1～62.8℃半小時，或71.7℃15～30秒鐘。常用于消毒牛奶和酒類等。
（5）高壓蒸汽滅菌法：壓力蒸汽滅菌是在專門的壓力蒸汽滅菌器中進行的，是熱力滅菌中使用普遍、效果可靠的一種方法。其優點是穿透力強，滅菌效果可靠，能殺滅所有微生物。目前使用的壓力滅菌器可分為兩類：下排氣式壓力滅菌器和預真空壓力滅菌器。適用于耐高溫、耐水物品的滅菌。
2．干熱滅菌法干熱滅菌比濕熱滅菌需要更高的溫度與較長的時間。
（1）干烤：利用干烤箱，加熱160～180℃2小時，可殺死一切微生物，包括芽胞菌。主要用于玻璃器皿、瓷器等的滅菌。
（2）燒灼和焚燒：燒灼是直接用火焰殺死微生物，適用于微生物實驗室的接種針等不怕熱的金屬器材的滅菌。焚燒是徹底的消毒方法，但只限于處理廢棄的污染物品，如無用的衣物、紙張、垃圾等。焚燒應在專用的焚燒爐內進行。
（3）紅外線：紅外線輻射是一種0.77～1000微米波長的電磁波,有較好的熱效應,尤以1～10微米波長的熱效應最強。亦被認為一種干熱滅菌。紅外線由紅外線燈泡產生,不需要經空氣傳導，所以加熱速度快，但熱效應只能在照射到的表面產生，因此不能使一個物體的前后左右均勻加熱。紅外線的殺菌作用與干熱相似，利用紅外線烤箱滅菌的所需溫度和時間亦同于干烤。多用于醫療器械的滅菌。人受紅外線照射較長會感覺眼睛疲勞及頭疼；長期照射會造成眼內損傷。因此，工作人至少應戴能防紅外線傷害的防護鏡。
（4）微(wei)(wei)波(bo)(bo)：微(wei)(wei)波(bo)(bo)是一種(zhong)波(bo)(bo)長為1毫米(mi)到(dao)1米(mi)左右的(de)電(dian)磁波(bo)(bo)，頻率較高(gao)，可(ke)穿(chuan)透玻璃(li)、塑(su)料薄膜與陶瓷(ci)等物(wu)質(zhi)，但不能(neng)穿(chuan)透金(jin)屬表面(mian)。微(wei)(wei)波(bo)(bo)能(neng)使介(jie)質(zhi)內雜亂無章(zhang)的(de)極性分子在微(wei)(wei)波(bo)(bo)場的(de)作用(yong)(yong)(yong)(yong)下，按波(bo)(bo)的(de)頻率往(wang)返運動，互相沖(chong)撞和(he)磨擦而(er)產生熱，介(jie)質(zhi)的(de)溫度可(ke)隨(sui)之升高(gao)，因而(er)在較低的(de)溫度下能(neng)起到(dao)消(xiao)毒作用(yong)(yong)(yong)(yong)。一般(ban)認為其殺菌機理(li)除(chu)熱效(xiao)應(ying)(ying)以外(wai)，還有電(dian)磁共振效(xiao)應(ying)(ying)，場致力(li)效(xiao)應(ying)(ying)等的(de)作用(yong)(yong)(yong)(yong)。消(xiao)毒中常(chang)用(yong)(yong)(yong)(yong)的(de)微(wei)(wei)波(bo)(bo)有2450MHZ與915MHZ兩種(zhong)。微(wei)(wei)波(bo)(bo)照(zhao)射(she)多用(yong)(yong)(yong)(yong)于(yu)(yu)食(shi)(shi)品(pin)加工。在醫院中可(ke)用(yong)(yong)(yong)(yong)于(yu)(yu)檢驗(yan)室用(yong)(yong)(yong)(yong)品(pin)、非金(jin)屬器械、無菌病室的(de)食(shi)(shi)品(pin)食(shi)(shi)具、藥杯及(ji)其它用(yong)(yong)(yong)(yong)品(pin)的(de)消(xiao)毒。微(wei)(wei)波(bo)(bo)長期照(zhao)射(she)可(ke)引起眼睛的(de)晶狀混濁、睪(gao)丸損傷和(he)神經功能(neng)紊亂等全身性反應(ying)(ying)，因此必須關好門后才開始操作。